围绕动物疫病防控与公共卫生安全需求，我院动卫所立足人工繁育野生动物流行病学调查、疫源疫病监测预警，持续开展病原本底调查、病原遗传演化解析及现场快速检测技术攻关和研究。近期，动卫所王晓虎研究员团队在“野生动物-养殖场-市场界面”的病毒多样性、鹦鹉博尔纳病毒流行特征、果子狸圆环病毒基因组解析及现场快速检测技术方面取得系列进展，累计发表4篇高水平学术论文，相关成果发表于Microbiome（中科院生物学一区TOP，IF=14.9）、BMC Veterinary Research（中科院农林科学二区），IF=3.1和Virologica Sinica（中科院医学二区，IF=4.7）期刊，科研创新与技术赋能成效显著。

　　研究团队将宏病毒组测序与特异性核酸检测相结合，面向冠状病毒、圆环病毒、鹦鹉博尔纳病毒等重要病原开展精准鉴定和遗传演化分析，系统积累不同宿主、地区及饲养条件下的病原基础数据库。同时，将宏病毒组分析拓展至野生动物、养殖场环节、市场多界面生态场景，解析不同环境下病毒群落组成、多样性特征及跨宿主传播风险，面向野生动物养殖、收容救护一线的现场筛查痛点，推动病原基础研究成果向快速检测技术转化，为常态化疫病监测、风险排查储备实用技术工具。

　　本系列成果是团队长期系统性检测工作的阶段性突破：一是在界面监测方面，团队采集广东省野生、养殖及市场相关环境样本共279份开展宏转录组分析，涵盖15个宿主目，鉴定出106个脊椎动物相关病毒谱系，其中包含19种潜在新病毒。研究发现，市场相关样本的病毒丰富度和多样性总体高于野生和养殖样本，且市场相关宿主群体在病毒-宿主关联网络中连通性更强，提示市场环境在野生动物-家养动物-人界面具有重要的病毒连通作用（Liu, et al. Microbiome, 2026）。二是在病原监测方面，团队对广东省16个地市442只鹦鹉开展病原筛查，检出鹦鹉博尔纳病毒2型、4型和5型，并发现三种基因型在同一养殖场共存，补充了人工饲养鹦鹉相关病毒的流行及遗传多样性资料（Zhang, et al. BMC Veterinary Research, 2026）。三是在病原鉴定方面，团队对广东省5个地市103只人工繁育果子狸开展监测，成功获得4个果子狸圆环病毒全长基因组，填补了我国大陆果子狸圆环病毒研究数据空白（Zhang, et al. Virologica Sinica, 2026）。四是在现场快速检测技术方面，团队成功建立鹦鹉博尔纳病毒4型EmDEA等温核酸检测方法，全程检测时长约30分钟，最低检测限为5 copies/μL；经270份临床组织样品验证，与常规RT-PCR的总体符合率为97.03%，为现场快速筛查提供了新的技术选择（Qian, et al. BMC Veterinary Research, 2026）。

　　该系列研究进一步完善广东省人工繁育及圈养野生动物病毒本底数据库，从“野生动物-养殖场-市场界面”多界面视角阐明病毒多样性与跨宿主连通特征，为重点病原常态化监测、疫病风险预警、现场快速检测提供坚实科学支撑与技术方案。下一步，团队将聚焦病原动态监测、遗传演化与防控技术研发，深化跨单位协同创新，持续为野生动物健康管理、动物疫病防控及公共卫生安全提供科技支撑。

　　相关研究联合广东省科学院动物研究所、广东省野生动物监测救护中心、华南农业大学、广州动物园、仲恺农业工程学院、华大研究院等单位共同完成，得到广东省生态林业建设专项资金、广东省科技计划项目、广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目及广州市科技计划项目等项目资助。

　　图1 野生、市场及养殖样本的脊椎动物相关病毒组概况，包括病毒科分布与丰度、基因组完整度及宿主/环境组检出率

　　原文链接：

　　1. Animal markets are associated with elevated viral diversity and virus-host connectivity across wildlife-farm interfaces.

　　 https://doi.org/10.1186/s40168-026-02558-8

　　2. Molecular epidemiology of parrot bornaviruses in Guangdong, China: co-circulation of three genotypes in captive parrots.

　　 https://doi.org/10.1186/s12917-026-05885-y

　　3. Identification and genome characterization of circovirus in masked palm civets (Paguma larvata) from Guangdong Province, China.

　　 https://doi.org/10.1016/j.virs.2026.09.001

　　4. Establishment and application of EmDEA, a rapid on-site nucleic acid detection method for parrot bornavirus type 4.

　　 https://doi.org/10.1186/s12917-025-05236-3