基因测序及基因组学平台,是2012年依托中国农业科技华南创新中心搭建的Illumina公司MiSeq测序仪和NextSeq500测序仪的测序平台。可以针对不同的需求实现更专门的应用,提供多种测序读长、通量和时间周期选择,满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域; 可与传统临床医学、动物医学的最新科研结果结合,形成精准医疗,为疾(疫)病诊断、治疗、临床决策、毒株变异监测等带来革命性、颠覆性、去“卡脖子”性的改变及发展。
一、服务内容:
主要为科研、高校、企业研发机构等提供完整的基因检测研究方案,集咨询、样品制备、建库、测序、数据质量检测、深度的生物信息分析为一体。根据用户要求进行个性化实验设计及数据分析,解决数据分析难题和提供论文撰写咨询。
主要服务内容:新基因组测序-组装, 基因组重测序-SNP分析,简化基因组测序-QTL定位,转录组测序-组装-差异表达基因分析等。
精准服务项目包括:
l 动植物基因组测序
全基因组de novo测序
l 外显子组测序
SNP遗传图谱构建
全基因组关联分析
BSA性状定位分析
群体进化分析
l 动植物转录组测序
全长转录组
宏转录组测序
比较转录组测序
lncRNA测序
circRNA测序
small RNA测序
l 动植物表观组测序
全基因组甲基化测序
ChIP-seq
RIP-seq
l 微生物基因组测序
细菌基因组de novo测序
真菌基因组de novo测序
16S/18S/ITS等扩增子测序
宏基因组测序
二、服务流程
从材料选取,建库测序,到数据分析,确保科学和缜密,以保障高质量研究成果。
三、应用案例
(一)科研服务:被广泛应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域。
(Genes, 2020, 11:161-179) (Microbiology resource announcement, 2019,3: e01552-18)
仪器设备 应用领域
代表成果(论文)
MiSeq
转录组测序
MiSeq
微生物基因组测序
(二)产业服务:
1.养殖:易感基因筛查、早期诊断、精准监测、精准免疫;
2.疫苗: 疫苗毒株筛选分析;临床变异监测;靶标挖掘;数据库建设;
3.微生物:优势菌筛选,精准调控;保种,靶标挖掘;
4.其他:基因数据分析及基因数据库定制。
联系方式
联系人:朱老师
联系电话: 020-85161412,13826466467
电子邮箱:zhuqingfeng @agrogene.ac.cn
地址:广州市天河区金颖路20号创新大楼13楼