广东省农业科学院农业生物基因研究中心基因测序及基因组学技术平台
2020-05-09 11:20  作者:2020-05-09  作者:

        基因测序及基因组学平台,是2012年依托中国农业科技华南创新中心搭建的Illumina公司MiSeq测序仪和NextSeq500测序仪的测序平台。可以针对不同的需求实现更专门的应用,提供多种测序读长、通量和时间周期选择,满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域; 可与传统临床医学、动物医学的最新科研结果结合,形成精准医疗,为疾(疫)病诊断、治疗、临床决策、毒株变异监测等带来革命性、颠覆性、去“卡脖子”性的改变及发展。

一、服务内容:

       主要为科研、高校、企业研发机构等提供完整的基因检测研究方案,集咨询、样品制备、建库、测序、数据质量检测、深度的生物信息分析为一体。根据用户要求进行个性化实验设计及数据分析,解决数据分析难题和提供论文撰写咨询。

主要服务内容:新基因组测序-组装, 基因组重测序-SNP分析,简化基因组测序-QTL定位,转录组测序-组装-差异表达基因分析等。

精准服务项目包括:

动植物基因组测序

    全基因组de novo测序

外显子组测序

SNP遗传图谱构建

全基因组关联分析

BSA性状定位分析

群体进化分析

动植物转录组测序

全长转录组

   宏转录组测序

比较转录组测序

lncRNA测序

circRNA测序

small RNA测序

动植物表观组测序

全基因组甲基化测序

ChIP-seq

RIP-seq

微生物基因组测序

细菌基因组de novo测序

真菌基因组de novo测序

16S/18S/ITS等扩增子测序

宏基因组测序

二、服务流程

从材料选取,建库测序,到数据分析,确保科学和缜密,以保障高质量研究成果。

三、应用案例
(一)科研服务:被广泛应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域。

 
仪器设备
 应用领域  代表成果(论文)
 MiSeq  
转录组测序

 

(Genes, 2020, 11:161-179)

 MiSeq  微生物基因组测序

 

(Microbiology resource announcement, 2019,3: e01552-18)

(二)产业服务:
1.养殖:易感基因筛查、早期诊断、精准监测、精准免疫;
2.疫苗: 疫苗毒株筛选分析;临床变异监测;靶标挖掘;数据库建设;
3.微生物:优势菌筛选,精准调控;保种,靶标挖掘;
4.其他:基因数据分析及基因数据库定制。

联系方式
联系人:朱老师
联系电话: 020-85161412,13826466467
电子邮箱:zhuqingfeng @agrogene.ac.cn
地址:广州市天河区金颖路20号创新大楼13楼

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